Associations, Groupes de recherche

• ACLF : Association des Cytogénéticiens de Langue Française
  http://www.eaclf.org/
  Site web de l’Association
• ECA : European Cytogeneticists Association
  http://www.e-c-a.eu/EN/
  site web de l’association. Annonces de congrès, lettre de l’association...
• GFCH : Groupe Français de Cytogénétique Hématologique
  http://www.infobiogen.fr/services/chromcancer/Associations/GFCH_fr.html
  
• GFCO : Groupe Français de Cytogénétique Oncologique
  http://www.infobiogen.fr/services/chromcancer/Associations/GFCO_fr.html
  
• ORPHANET
  http://www.orpha.net
  Le portail des maladies rares et des médicaments orphelin
• AGT : Association of Genetic Technologists
  http://www.applmeapro.com/agt.htm
  
• ESHG : European Society of Human Genetics
  http://www.eshg.org/
  
• SFGH : Société française de Génétique Humaine
  http://www.sfgh.net/login.asp?RequestedAsso=sfgh&pouet=
  
• AFC : Association Française de Cytométrie
  http://www-sante.ujf-grenoble.fr/SANTE//AFC/afc.html
  
• CNRS
  http://www.CNRS.fr/
  
• INSERM
  http://birbpi.inserm.fr:8001/
  
• Journal Officiel
  http://www.legifrance.gouv.fr/
  
• Medical Research Council:
  http://www.mrc.ac.uk
  
• Réseau ACPA
  http://www.renapa.univ-montp1.fr/
  Portail web du Réseau d'Analyse Chromosomique sur Puces à ADN

Cytogénétique médicale

Cytogénétique

• HCForum
  https://www.hc-forum.net/HCForum/Html/Francais/index.html
  Base de donnée répertoriant plus de 1500 translocations familiales. Aide au conseil génétique en donnant une estimation du risque de naissance d'un enfant avec retard mental - syndrome polymalformatif.
• ECARUCA
  http://www.ecaruca.net
  Base de données répertoriant les anomalies chromosomiques déséquilibrées avec leurs phénotypes.
• MCNdn : Mendelian Cytogenetics Network Database
  http://mcndb.net/
  Site répertoriant les points de cassure associés à diverses pathologies. Ouvert à collaboration pour augmenter les cas répertoriés de translocations équilibrées à phénotype anormal. Proposent également des YACs pour affiner les localisations. Nouvelle version attendue pour début 2003.
• Chromosomal variation in man
  http://www.wiley.co.uk/products/subject/life/borgaonkar/index.html
  "Le ""Borgaonkar"" online."
• Atlas of genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology :
  http://www.infobiogen.fr/services/chromcancer
  Remaniements, points de cassure, gènes impliqués dans les pathologies néoplasiques.
• Mitelman Database of chromosome aberrations in Cancer
  http://cgap.nci.nih.gov/Chromosomes/Mitelman
  
• The Cancer Genome Anatomy Project (CGAP):
  http://cgap.nci.nih.gov
• Information for genetic professionals:
  http://www.kumc.edu/gec/geneinfo.html
  
• Database of Genomic Variants
  http://projects.tcag.ca/variation/
  Catalogue des variants de nombre de copies dans le génome humain
• DECIPHER
  http://decipher.sanger.ac.uk/
  Registre des microremaniements cytogénétiques désequilibrés

Génétique clinique

• Online Mendelian Inheritence in Man (OMIM)
  http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Omim/searchomim.html
  
• Medical Genetics Web Site
  http://medgen.genetics.utah.edu
  
• The Dysmorphic Human Mouse Homology Database (DHMHD)
  http://www.hgmp.mrc.ac.uk/DHMHD/dysmorph.html
  
• NORD : National Organisation for Rare Disorders
  http://www.rarediseases.org/
  
• Neonatal Diseases and Abnormalities
  http://www.mic.ki.se/Diseases/c16.html
  
• Information for genetic professionals:
  http://www.kumc.edu/gec/geneinfo.html
  

Images

• Cytogenetics Gallery
  http://www.pathology.washington.edu/Cytogallery/
  
• WebPath - Prenatal Diagnosis
  http://medlib.med.utah.edu/WebPath/TUTORIAL/PRENATAL/PRENATAL.html
  
• Web Path
  http://www-medlib.med.utah.edu/WebPath/webpath.html
  
• Animations chromosomiques
  http://www.tokyo-med.ac.jp/genet/index-e.htm
  
• The visual world of genetics for researchers, educators and artists:
  http://www.cytopix.com
  

Ressources Biologiques

Banques de cellules, ADN, YACs, Plasmides, BACs, PACs, etc...

• Coriell Cell Repositories :
  http://arginine.umdnj.edu/ccr/ccrsumm.html
  
• American Type Culture Collection (ATCC) :
  http://www.atcc.org/
  
• European Collection of Cell Cultures (ECACC) :
  http://www.ecacc.org.uk/
  
• German Collection of Microorganisms and Cell Cultures (DSMZ) :
  http://www.gbf-braunschweig.de/dsmz/
  
• CEPH
  http://www.cephb.fr
  
• Resources for Molecular Cytogenetics
  http://www.biologia.uniba.it/rmc/
  Ce site propose différentes sondes : peinture (chromosomes entiers ou partiels) dérivées d’hybrides somatiques, YACs du CEPH, BACs.
• UK Human Genome Mapping Project Resource Centre
  http://www.hgmp.mrc.ac.uk/
  
• Resource center/primary database RZPD
  http://www.rzpd.de/
  
• BAC/PAC Ressources
  http://www.chori.org/bacpac/home.htm
  
• CCAP BAC clones
  http://cgap.nci.nih.gov/Chromosomes/CCAP_BAC_Clones
  Site proposant une liste de BACs localisés par FISH et STS, organisés par chromosomes.
• Clone Registry
  http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/clone/clname.cgi?stype=Id&list=599276&TransHist=0
  Site proposant une fiche complète sur tous (ou presque) les BACs issus du séquençage du génome humain (Position, gène, STS, liens vers la séquence, laboratoire pouvant fournir le clone …)
• UK Human Genome Mapping Project Resource Centre:
  http://www.hgmp.mrc.ac.uk
  

Banques de données

• European Bioinformatics Institute (EMBL) :
  http://www.ebi.ac.uk/ebi_home.html
  
• The Sanger Center
  http://www.sanger.ac.uk/
  
• Telomere atlas
  http://www.genes.uchicago.edu/
  
• TelDB
  http://www.genlink.wustl.edu/teldb/index.html
  Site dédié aux télomères : liens, articles etc…
• Chromosome Search
  http://www.ir.miami.edu/genetics/sergg/chromosome.html
  
• Comparative genomic hybridization (CGH)
  http://amba.charite.de/cgh/
  Base de donnée répertoriant les résultats obtenus en CGH pour de nombreuses lignées tumorales, exemples d'images, protocoles, liens vers d'autres sites
• Enhancer Browser
  http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC1716724/
  Une base de données répertoriant les séquences activatrices validées chez l'homme et la souris
• Geneimprint
  http://www.geneimprint.com/site/home
  Base de données répertoriant les articles relatif à l'empreinte parentale et listant les gènes soumis à empreinte(validés ou candidats)

Cartographie

• Human Genome Browser
  http://genome.cse.ucsc.edu/goldenPath/hgTracks.html
  Site intégrant sous forme graphique l’ensemble des données issues du programme génome humain. Mises à jour une ou deux fois par an.
• Ensembl Genome Server
  http://www.ensembl.org
  Autre site identique au précédent, à la présentation différente.
• Genemap 99
  http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genemap/
  Cartographie des principaux marqueurs localisés sur tous les chromosomes
• UW pathology cytogenetics resources and genome project related tools
  http://www.pathology.washington.edu/research/cytopages/GM/chromo.html
  Propose une recherche graphique (en cliquant sur les idéogrammes) de marqueurs ou de maladies , en relation avec les bases GDB et OMIM.
• NCBI Map viewer
  http://www.ncbi.nlm.nih.gov/mapview/map_search.cgi?chr=hum_chr.inf&query
  Cartographie des STS sur la carte génétique. Liens avec Genbank
• The human transcript map
  http://www.ncbi.nlm.nih.gov/SCIENCE96/
  cartographie (MARS 96 !!!) des gènes localisés: visualisation graphique de la densité des gènes sur chaque chromosome, liste des gènes, séquence... Liens avec les autres sites de cartographie.
• A new gene map of the Human Genome
  http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genemap99/
  Mise à jour du site précédent
• GENATLAS
  http://www.dsi.univ-paris5.fr/genatlas/
  localisation des gènes et maladies connues sur les différents segments chromosomiques. Cartographie comparée avec d’autres espèces
• Genecards
  http://bioinformatics.weizmann.ac.il/cards/
  Fiche complète sur toutes les informations connue pour chaque gène (position, séquences nucléique et protéique, liens etc…)
• Gene Lynx
  http://www.genelynx.org/cgi-bin/a?page=home
  Idem site précédent

Idéogrammes

• UW Pathology Cytogenics Resources
  http://www.pathology.washington.edu/cytopages/
  Idéogrammes en téléchargement (format PDF) : homme, souris, cheval
• Resources for Molecular Cytogenetics
  http://www.biologia.uniba.it/rmc/
  Idéogrammes en bandes G à diverses résolutions

Portails

• HUGO
  http://www.gdb.org/hugo/
  Portail offrant pour chaque chromosome des liens classés par thème vers tous les sites le concernant.
• Chromosome Webwatch
  http://www.chromosome.net/index.html
  Très nombreux liens vres des sites de ressources, de bibliographie, de génétique

Ressources informatiques

Bio informatique

• REBASE
  http://rebase.neb.com/rebase/rebase.html
  Tout sur les enzymes de restriction
• Bioinformatics Resources
  http://biotools.umassmed.edu/
  Nombreux outils informatiques online
• Infobiogen
  http://www.infobiogen.fr/services/menuserv.html
  Recherche et analyses de séquences nucléiques, protéiques, phylogénie …
• National Human Genome Research Institute (NHGRI)
  http://www.nhgri.nih.gov/
  Liens vers les différents centres participant au projet génome humain
• HGMP-RC Bioinformatics
  http://www.hgmp.mrc.ac.uk/Bioinformatics/
  
• NCBI : Tools for data mining
  http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Tools/index.html
  
• MethTools
  http://genome.imb-jena.de/methtools/
  Outils permettant de visualiser et analyser l'état de méthylation de séquences d' ADN

Moteurs de recherche, sites proposant des liens vers des serveurs biologiques

• Mamma
  http://www.mamma.com/index.html
  Métamoteur de recherche, utilisant les index des différents programmes de recherche existant sur le Web : AltaVista, Lycos, Excite, WebCrawler, Yahoo etc...
• Institut Pasteur
  http://www.pasteur.fr/
  
• Infobiogen
  http://www.infobiogen.fr
  
• MDChoice
  http://www.mdchoice.com/index.asp
  
• Chromosome Webwatch
  http://www.chromosome.net/index.html
  Très nombreux liens vres des sites de ressources, de bibliographie, de génétique

Bibliographie

• Table of Contents of Selected Scientific Journals
  http://linkage.rockefeller.edu/outside/journals.html
  
• BIUM Paris
  http://www.bium.univ-paris5.fr/
  
• Bibliothèque de l'institut Pasteur
  http://www.pasteur.fr/units/biblio/
  
• Journaux gratuits online
  http://www.freemedicaljournals.com/
  
• PubMed
  http://www3.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed
  

Laboratoires

Microscopes

• Nikon
  http://www.ave.nikon.co.jp/inst/Biomedical/index.htm
• Zeiss
  http://www.zeiss.fr/fr/micro/home.nsf/allBySubject/Launch+-+Zeiss-engl+NotesTemplate
• Olympus
  http://cf.olympus-europa.com/micro/home.cfm
• Olympus - France
  http://www.olympus.fr/
• Leica
  http://www.microscopy-imaging.com/website%5Cproducts.nsf/(ALLIDs)/5C1D54D5B8EF7C6080256B81005634DD
• P.A.L.M.
  http://www.palm-mikrolaser.com/

Analyseurs d'images

• Alphelys (Genikon)
  http://www.alphelys.com/fr/pBICY_Cytogenetique.htm
• Applied Imaging ( Cytovision)
  http://www.aicorp.com/
• Digital Scientific (SmartCapture)
  http://www.digitalscientific.co.uk/
• Metatsystems ( Ikaros - Isis)
  http://www.metasystems.org/
• Leica
  http://www.microscopy-imaging.com/
• IMSTAR (Pathfinder)
  http://www.imstar.fr/
• Applied Spectral Imaging (Bandview - FISHview - SKYview)
  http://www.spectral-imaging.com/

Exercices de caryotypage

• The biology project - Karyotyping activity
  http://www.biology.arizona.edu/human_bio/activities/karyotyping/karyotyping.html

Protocoles

• Molecular Cytogenetics (FISH)
  http://ahsc.arizona.edu/~msrgsn/gd/gdvol13a.htm
• Donis Keller Lab lab manual
  http://hdklab.wustl.edu/lab_manual/index.html
• Technical TIPs Online
  http://tto.trends.com/
• Comparative genomic hybridization (CGH)
  http://amba.charite.de/cgh/

Guidelines

• Guidelines for Human Gene Nomenclature
  http://www.gene.ucl.ac.uk/nomenclature/guidelines.html
• International System for Human Cytogenetics Nomenclature:
  http://content.karger.com/produktedb/produkte.asp?typ=fulltext&file=000279442
  Principales modifications entre les versions 2005 et 2009 de l'ISCN