www.eACLF.org

Liste non exhaustive de liens intéressants

[ Mise à jour le 03-Nov-2007 20:35 ]

ASSOCIATIONS, GROUPES DE RECHERCHE

• Collège National des Enseignants et Praticiens de Génétique Médicale
  http://college-genetique.igh.cnrs.fr/
• ATC Association des Techniciens en Cytogénétique:
  http://www.asstc.net
• GFCH, Groupe Français de Cytogénétique Hématologique
  http://atlasgeneticsoncology.org/Associations/GFCH_fr.html
• GFCO, Groupe Français de Cytogénétique Oncologique
  http://atlasgeneticsoncology.org/Associations/GFCO_fr.html
• ECA, European Cytogeneticists Association:
  http://www.biologia.uniba.it/eca/
  site web de l’association. Annonces de congrès, lettre de l’association...
• The American College of Medical Genetics:
  http://www.acmg.net
• ESHG : European Society of Human Genetics:
  http://www.eshg.org
• UNIQUE, Rare Chromosome Disorder Support Group:
  http://www.rarechromo.org
• UK Cancer Cytogenetics Group:
  http://www.ukccg.org.uk
• German Society of Human Genetics
  http://www.gfhev.de
• International Federation of Human Genetic Societies:
  http://www.ithgs.org/
• International Association of Environmental Mutagen Societies:
  http://www.iaems.org.nz/
• Italian Society of Human Genetics (SIGU):
  http://sigu.univr.it
• SPAMA : Soins Palliatifs en Maternité
  http://spama.asso.fr
• SFGH : Société française de Génétique Humaine
  http://www.sfgh.net/sfgh_front/login.asp
• AFC : Association Française de Cytométrie
  http://www.afc.asso.fr/pages/accueilpag.html
• CNRS :
  http://www.CNRS.fr/
• INSERM :
  http://www.inserm.fr/
• Journal Officiel
  http://www.admi.net/jo/ ou http://www.legifrance.gouv.fr/
  

RESSOURCES

Banques de cellules, ADN, YACs, Plasmides, BACs, PACs, etc...

• American Type Culture Collection (ATCC) :
  http://www.atcc.org/
• European Collection of Cell Cultures (ECACC) :
  http://www.ecacc.org.uk/
• German Collection of Microorganisms and Cell Cultures (DSMZ) :
  http://www.gbf-braunschweig.de/dsmz/
• CEPH :
  http://www.cephb.fr
• Resources for Molecular Cytogenetics
  http://www.biologia.uniba.it/rmc/
  Ce site propose différentes sondes : peinture (chromosomes entiers ou partiels) dérivées d’hybrides somatiques, YACs du CEPH, BACs.
• UK Human Genome Mapping Project Resource Centre
  http://www.hgmp.mrc.ac.uk/
• Resource center/primary database RZPD
  http://www.rzpd.de/
• BAC/PAC Ressources
  http://www.chori.org/bacpac/home.htm
  Site présentant l’ensemble des BAC/PAC des librairies RPCI. Cependant, ces BAC/PAC sont payants.
• The Sanger Center
  http://www.sanger.ac.uk/Teams/Team38/CloneRequest/help.shtml
  Site proposant une grande partie des BACs de différentes librairies, gratuitement.
• CCAP BAC clones
  http://cgap.nci.nih.gov/Chromosomes/CCAP_BAC_Clones
  Site proposant une liste de BACs localisés par FISH et STS, organisés par chromosomes.
• Clone Registry
  http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/clone/clname.cgi?stype=Id&list=599276&TransHist=0
  Site proposant une fiche complète sur tous (ou presque) les BACs issus du séquençage du génome humain (Position, gène, STS, liens vers la séquence, laboratoire pouvant fournir le clone …)
  

Bases de donnees

• European Bioinformatics Institute (EMBL) :
  http://www.ebi.ac.uk/ebi_home.html
• The Sanger Center
  http://www.sanger.ac.uk/
• Atlas of genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology :
  http://atlasgeneticsoncology.org
  Remaniements, points de cassure, gènes impliqués dans les pathologies néoplasiques.
• Human Imprinting Map
  http://genes.uchicago.edu/upd/
  Carte des chromosomes soumis à empreinte, bibliographie associée.
• Telomere atlas
  http://www.genes.uchicago.edu/telomere/telomere.html
• TelDB
  http://www.genlink.wustl.edu/teldb/index.html
  Site dédié aux télomères : liens, articles etc
• MCNdn : Mendelian Cytogenetics Network Database
  http://www.mcndb.org/index.jsp
  Site répertoriant les points de cassure associés à diverses pathologies. Ouvert à collaboration pour augmenter les cas répertoriés de translocations équilibrées à phénotype anormal. Proposent également des YACs pour affiner les localisations.
  Nouvelle version attendue pour début 2003.
• Chromosomal variation in man
  http://www.wiley.co.uk/products/subject/life/borgaonkar/index.html
  Le "Borgaonkar" online.
• Mitelman Database of chromosome aberrations in Cancer
  http://cgap.nci.nih.gov/Chromosomes/Mitelman
• HCForum
  https://hcforum.imag.fr/
  Base de donnée répertoriant plus de 1500 translocations familiales. Aide au conseil génétique en donnant une estimation du risque de naissance d'un enfant avec retard mental - syndrome polymalformatif.
• ECARUCA
  http://www.ecaruca.net/
  Base de donnée répertoriant les anomalies chromosomiques et les phénotypes correspondant. Le site est en cours de développement et devrait permettre d’effectuer des recherches à partir de l’année prochaine.
• Comparative genomic hybridization (CGH)
  http://amba.charite.de/cgh/
  Base de donnée répertoriant les résultats obtenus en CGH pour de nombreuses lignées tumorales, exemples d'images, protocoles, liens vers d'autres sites

 

Cartographie

• Human Genome Browser
  http://genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgGateway?org=human
  Site intégrant sous forme graphique l’ensemble des données issues du programme génome humain. Mises à jour une ou deux fois par an.
• Ensembl Genome Server
  http://www.ensembl.org
  Autre site identique au précédent, à la présentation différente.
• NCBI Human Genome Ressources
  http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/guide/human/
  Cartographie des principaux marqueurs localisés sur tous les chromosomes
• UW pathology cytogenetics resources and genome project related tools
  http://www.patholog y.washington.edu/research/cytopages/GM/chromo.html
  Propose une recherche graphique (en cliquant sur les idéogrammes) de marqueurs ou de maladies , en relation avec les bases GDB et OMIM.
• NCBI Map viewer
  http://www.ncbi.nlm.nih.gov/mapview/map_search.cgi?chr=hum_chr.inf&query
  Cartographie des STS, des gènes, des clones etc… sur la carte génétique. Liens avec Genbank
• Gene map 99
  http://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/genome/genemap99/
  cartographie des gènes localisés: visualisation graphique de la densité des gènes sur chaque chromosome, liste des gènes, séquence... Liens avec les autres sites de cartographie.
• GENATLAS
  http://www.dsi.univ-paris5.fr/genatlas/
  localisation des gènes et maladies connues sur les différents segments chromosomiques; cartographie comparée avec d’autres espèces
• Genecards
  http://bioinformatics.weizmann.ac.il/cards/
  Fiche complète sur toutes les informations connue pour chaque gène (position, séquences nucléique et protéique, liens etc…
• Gene Lynx
  http://www.genelynx.org/cgi-bin/a?page=home
  Idem site précédent

 

Bio informatique

• REBASE
  http://rebase.neb.com/rebase/rebase.html
  Tout sur les enzymes de restriction
• Bioinformatics Resources
  http://biotools.umassmed.edu/
  Nombreux outils informatiques online
• Infobiogen
  http://www.infobiogen.fr/services/analyse/analyse.php
  Recherche et analyses de séquences nucléiques, protéiques, phylogénie …
• Draft Human Genome Browser
  http://genome.ucsc.edu/goldenPath/hgTracks.html
  Recherche des séquences obtenues dans le cadre du projet de génome humain
• National Human Genome Research Institute (NHGRI)
  http://www.nhgri.nih.gov/
  Liens vers les différents centres participant au projet génome humain
• HGMP-RC Bioinformatics
  http://www.hgmp.mrc.ac.uk/Bioinformatics/
• NCBI : Tools for data mining
  http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Tools/index.html
• MethTools
  http://genome.imb-jena.de/methtools/
  Outils permettant de visualiser et analyser l'état de méthylation de séquences d' ADN
  

Idéogrammes

• UW Pathology Cytogenics Resources
  http://www.pathology.washington.edu/cytopages/
  Idéogrammes en téléchargement (format PDF) : homme, souris, cheval
• Resources for Molecular Cytogenetics
  http://www.biologia.uniba.it/rmc/
  Idéogrammes en bandes G à diverses résolutions

Portails

• HUGO
  http://www.gdb.org/hugo/
  Portail offrant pour chaque chromosome des liens classés par thème vers tous les sites le concernant.
• Chromosome Webwatch
  http://www.chromosome.net/index.html
  Très nombreux liens vers des sites de ressources, de bibliographie, de génétique
  

 

GENETIQUE CLINIQUE

• Online Mendelian Inheritence in Man (OMIM)
  http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=OMIM&cmd=Limits
  Base de donnée des maladies génétiques avec pour chacune un résumé (complet) et une bibliographie. Cartographie des différents loci.
• Medical Genetics Web Site
  http://medgen.genetics.utah.edu
  Présentation de diverses maladies génétiques, photos de malades, liens vers d’autres sites de génétique clinique et vers des sites d’associations de malades.
• The Dysmorphic Human Mouse Homology Database (DHMHD)
  http://www.hgmp.mrc.ac.uk/DHMHD/dysmorph.html
  Site répertoriant les anomalies chromosomiques associées à divers syndromes polymalformatifs. Equivalent chez la souris, régions chromosomiques homologues entre l'homme et la souris
• ORPHANET
  http://orphanet.infobiogen.fr
  Catalogue des maladies rares, avec pour chacune la liste des cliniciens et des labo spécialisés et éventuellement un lien vers les associations de malades.
• NORD : National Organisation for Rare Disorders
  http://www.rarediseases.org/
  Même type de site, en anglais.
• Neonatal Diseases and Abnormalities
  http://www.mic.ki.se/Diseases/c16.html
  Nombreux liens vers des sites dédiés à de nombreuses pathologies.
  

DIVERS

Images

• Cytogenetics Gallery
  http://www.pathology.washington.edu/Cytogallery/
• WebPath - Prenatal Diagnosis
  http://medlib.med.utah.edu/WebPath/TUTORIAL/PRENATAL/PRENATAL.html
  images et brefs descriptifs en rapport avec les pathologies anténatales
• Web Path
  http://www-medlib.med.utah.edu/WebPath/webpath.html
  Collection d’images (macroscopie et histologie) illustrant diverses pathologies, associées à de brefs rappels.
  

Exercices de caryotypage

• The biology project - Karyotyping activity
  http://www.biology.arizona.edu/human_bio/activities/karyotyping/karyotyping.html
  3 caryotypes (en bandes G) à finir et le diagnostic à donner. Amusant mais sans plus.
  

Protocoles

• Molecular Cytogenetics (FISH)
  http://ahsc.arizona.edu/~msrgsn/gd/gdvol13a.htm
  généralités sur la FISH : principes et applications. Intérêt?
• Protocol online
  http://www.protocol-online.org/prot/
  protocoles de culture cellulaire, cytogénétique, FISH; liens vers des sites proposant des protocoles de biologie moléculaire.
• Technical TIPs Online
  http://tto.trends.com/
• Comparative genomic hybridization (CGH)
  http://amba.charite.de/cgh/

Moteurs de recherche, sites proposant des liens vers des serveurs biologiques

• Mamma
  http://www.mamma.com/index.html
  Métamoteur de recherche, utilisant les index des différents programmes de recherche existant sur le Web : AltaVista, Lycos, Excite, WebCrawler, Yahoo etc...
• Institut Pasteur
  http://www.pasteur.fr/
• Infobiogen
  http://www.infobiogen.fr
• MDChoice
  http://www.mdchoice.com/index.asp
• Chromosome Webwatch
  http://www.chromosome.net/index.html
  Très nombreux liens vres des sites de ressources, de bibliographie, de génétique
  

 

BIBLIOGRAPHIE

Table des matières de journaux médicaux

• Table of Contents of Selected Scientific Journals
  http://linkage.rockefeller.edu/outside/journals.html
• BIUM Paris
  http://www.bium.univ-paris5.fr/
• Bibliothèque de l'institut Pasteur
  http://www.pasteur.fr/units/biblio/
• Liste des Journaux gratuits online
  http://www.freemedicaljournals.com/
  

Recherche biblio

• PubMed
  http://www3.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed
• BioMedlink Library
  http://research.bmn.com/medline